दक्षिण सूडान के निवासियों के एक विश्वविद्यालय या एक व्यावसायिक स्कूल में या तो उच्च शिक्षा प्राप्त करने का विकल्प है। दोनों संस्थानों की कमी नहीं है, कई कार्यक्रमों दक्षिण सूडान में उच्च शिक्षा की वर्तमान परिदृश्य का विस्तार करने के लिए जगह में हैं।

विज्ञान डिग्री के मास्टर उन्नत शैक्षिक कार्यक्रम है कि छात्रों को, जो पहले से ही एक स्नातक की डिग्री प्राप्त की है, कॉलेजों और विश्वविद्यालयों द्वारा की पेशकश कर रहे हैं। एमएससी कमाई स्नातकों के लिए अधिक से अधिक पेशेवर और व्यक्तिगत अवसरों को जन्म दे सकती।