दक्षिण सूडान के निवासियों के एक विश्वविद्यालय या एक व्यावसायिक स्कूल में या तो उच्च शिक्षा प्राप्त करने का विकल्प है। दोनों संस्थानों की कमी नहीं है, कई कार्यक्रमों दक्षिण सूडान में उच्च शिक्षा की वर्तमान परिदृश्य का विस्तार करने के लिए जगह में हैं।

एक मास्टर कार्यक्रम एक केंद्रित डिग्री है कि कक्षा के कार्य, अनुसंधान, और संभवतः एक थीसिस कागज के बारे में दो साल अर्जित करने के लिए की आवश्यकता है। अध्ययन का यह उन्नत कार्यक्रम छात्रों आगे एक क्षेत्र है कि उन्हें हितों में उनकी स्कूली शिक्षा विशेषज्ञ की अनुमति देता है।